La gestione amministrativa e contabile del Centro è svolta dal Dipartimento cui afferisce il Direttore del Centro in conformità del Regolamento di Ateneo per l’amministrazione, la finanza e la contabilità.
È in ogni caso garantita la piena trasparenza nei riguardi di tutti i Dipartimenti aderenti al Centro tramite un aggiornamento periodico e sistematico della situazione contabile.